Este proyecto parte de la paradoja de Teseo. Ésta plantea si cuando a un objeto se le reemplazan todas sus partes sigue siendo el mismo. Se trata de una paradoja sobre la identidad discutida por filósofos como Heráclito y Platón.
La leyenda griega manuscrita por Plutarco narra que el barco utilizado por Teseo y los atenienses de su vuelta desde Creta fue conservado hasta los días de Demetrio de Falero. A éste, le iban reemplazando las tablas por nuevas una vez estropeadas. Siendo el centro de discusión si continuaba siendo el mismo o no, generando así la paradoja que lleva su nombre. Además, se plantea una cuestión adicional. Si se almacenan todas las partes retiradas y se construye otro barco con esas piezas, ¿cuál de los dos sería el original?
Proyecto Teseo extrapola esta situación a los materiales del cuerpo, intentando crear otro yo a partir del almacenaje de residuos orgánicos. ¿Podemos generar un nuevo yo?, ¿Cuál de los dos sería el original?